これはよくある質問です。毎日晩酌で1合くらい飲むなら、そのとおりに記入すればよいです。
それよりも少ない「月に数回」あるいは「年に数回」しか飲まないという場合は、「機会飲酒」という用語を用います。それによって、日常的に飲酒はしないが機会があれば飲酒をする状況を記入することができます。
たとえば、「機会飲酒、月2回～3回程度、ビール中ジョッキ3杯程度」と記入します。おおまかでかまいませんので申告するべきです。
これは喫煙でも同様です。たとえば（喫煙の機会が少なく）会社ではタバコを吸わないため、喫煙者と思われたくないことから問診票に記入しないとすれば、正確な申告とはいえません。人間ドックの実施施設には守秘義務があり、問診票の内容や検査結果が公表されることはありません。